Река Прут берет свое начало на юго-западном склоне горы Говерлы на расстоянии примерно 15 км к югу-югу-востоку от села Ворохта массива Черногоры Лесистых Карпат и впадает в Дунай к югу от села Джурджулешты, приблизительно на расстоянии 164 км от устья Дуная. Длина реки составляет 967 км, площадь водосборного бассейна – 27540 км2, перепад реки – 1577 м, общее падение – 163 (%о), средний коэффициент меандрирования – 2,1.
Бассейн реки Прут, будучи трансграничным бассейном, расположен на территории трех стран; в пределах Молдовы расположено 28% от общей площади бассейна, Украины – 33% и Румынии – 39%. В пределах Молдовы длина реки составляет 695 км, т.е. 71,9% от ее общей длины. Бассейн Прута включает в себя 41 бассейн малых рек длиной более 15 км, из которых 13 являются притоками первого порядка. Максимальная абсолютная высота территории бассейна 429,5 м, минимальная – 2,6 м.